Как учитывать франшизу при выставлении счета?

День добрый!
Я первый раз задаю вопрос, поэтому может что-то некорректно напишу.
Я бухгалтер в автосервисе, работаем со страховыми компаниями. Когда выставляем счет (с франшизой) и отправляем им на проверку, они нам его зарезают на сумму франшизы, и получается что у меня запчасти уходят в минус, а куда эту франшизу пристроить и как ее оформить я понять не могу. Объясните пожалуйста, кто с таким сталкивался